De nouvelles cibles médicamenteuses potentielles pour un type agressif de tumeur cérébrale ont été découvertes en laboratoire, grâce à une approche de « reverse engineering » utilisant l’édition d’ADN.
Des scientifiques de l’Université de Toronto, du Hospital for Sick Children et de l’Université de Calgary ont désactivé les gènes, un par un, dans des cellules souches cancéreuses spécialisées à l’aide de l’outil d’édition d’ADN CRISPR.
Les cellules souches provenaient de patients atteints d’un type agressif de tumeur cérébrale, appelée glioblastome.
Cette recherche à un stade précoce, publiée dans la revue Rapports de cellule, a découvert plusieurs points faibles dans les cellules cultivées en laboratoire qui pourraient être utilisées à l’avenir comme cibles potentielles pour le développement de médicaments.
Le Dr Daniel Tennant, expert en biologie du cancer de l’Université de Birmingham, a déclaré que les cellules souches de gliome sont des cellules tumorales cérébrales rares et agressives qui pourraient aider la maladie à réapparaître ou à devenir résistantes au traitement.
« Cibler ces cellules souches est difficile, car elles partagent un certain nombre de caractéristiques avec d’autres cellules souches importantes dans le cerveau », a-t-il déclaré.
L’identification de cibles médicamenteuses potentielles spécifiques à ces cellules souches pourrait orienter la recherche vers des traitements ciblés susceptibles de limiter les dommages aux cellules saines du cerveau.
Qu’est-ce que la « rétro-ingénierie » ?
Il s’agit de la première étude publiée à profiler et à identifier systématiquement ce qui fait fonctionner les cellules souches des tumeurs cérébrales à l’aide de la technologie d’édition de gènes appelée CRISPR.
À l’aide de CRISPR, l’équipe a soumis les cellules souches du glioblastome à des « écrans d’aptitude cellulaire ». La technique utilise une paire de « ciseaux » moléculaires, qui coupent et désactivent avec précision les gènes cibles dans les cellules souches du glioblastome, un par un, pour voir ce qui a aidé les cellules souches à survivre et à se développer.
Tennant a déclaré que l’équipe a ensuite « recherché des protéines sur les cellules souches de gliome qui sont essentielles à leur survie, mais pas essentielles pour d’autres types de cellules souches ».
Même si les tumeurs du glioblastome peuvent sembler très différentes d’un patient à l’autre, l’équipe a trouvé un total de 1007 gènes actifs dans au moins 6 échantillons sur 10. Ces résultats suggèrent qu’il existe un ensemble de gènes de base sur lesquels les tumeurs du glioblastome s’appuient pour survivre. Les chercheurs ont ensuite classé ces gènes cibles par ordre d’importance pour les étudier dans des projets de développement de médicaments ultérieurs.
Juste le début pour fabriquer de nouveaux médicaments
Le Dr Noor Gammoh, un scientifique sur les tumeurs cérébrales financé par Cancer Research UK de l’Université d’Édimbourg, a ajouté que bien que l’étude soit intéressante, ce n’est que le point de départ.
« La principale question qui hante toujours la recherche sur le glioblastome est de savoir si nous pouvons développer de petites molécules capables d’atteindre efficacement la tumeur et d’arrêter sa croissance. »
Tennant a ajouté que bien que cette étude ne soit que la première étape, elle a déjà suggéré un nombre important de nouvelles cibles qui pourraient être de bons candidats pour une enquête plus approfondie.
« Fait intéressant, ils ont trouvé des protéines qui semblaient uniques pour les cellules souches de gliome, qui dans un cas ont déjà un traitement expérimental conçu contre elles », a-t-il déclaré.
Les références
Macleod, G. et al (2019) Les écrans CRISPR-Cas9 à l’échelle du génome exposent les vulnérabilités génétiques et les mécanismes de sensibilité au témozolomide dans les cellules souches du glioblastome. Rapports de cellule doi.org/10.1016/j.celrep.2019.03.047