La plus grande base de données pour la découverte de médicaments anticancéreux passe à la 3D

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La plus grande base de données au monde pour la découverte de médicaments contre le cancer a été révolutionnée en ajoutant des structures 3D de protéines défectueuses et des cartes des réseaux de communication du cancer, selon une recherche financée par Cancer Research UK et publiée dans Nucleic Acid Research * aujourd’hui (lundi).

« Notre objectif est que les scientifiques du cancer disposent des données dont ils ont besoin pour mener des recherches vitales sur les médicaments les plus passionnants du futur » – Dr Bissan Al-Lazikani, The Institute of Cancer Research, Londres

La base de données canSAR mise à jour, développée à l’Institute of Cancer Research de Londres, permettra aux scientifiques travaillant au Royaume-Uni et dans le monde entier de concevoir plus efficacement de nouveaux traitements contre le cancer.

La base de données canSAR** a été lancée en 2011 par des chercheurs de la Cancer Research UK Cancer Therapeutics Unit de l’Institute of Cancer Research (ICR) – avec l’objectif ambitieux d’utiliser des approches Big Data pour dresser un tableau détaillé de la façon dont la majorité des humains connus les molécules se comportent.

canSAR a déjà rassemblé des milliards de mesures expérimentales cartographiant les actions d’un million de médicaments et de produits chimiques sur les protéines humaines, et a combiné ces données avec des informations génétiques et des résultats d’essais cliniques.

La nouvelle version de canSAR utilise l’intelligence artificielle pour identifier les coins et recoins à la surface des molécules cancérigènes défectueuses, comme une étape clé dans la conception de nouveaux médicaments pour les bloquer. Il permet également aux scientifiques d’identifier les lignes de communication qui peuvent être interceptées dans les cellules tumorales, ouvrant de nouvelles approches potentielles pour le traitement du cancer.

La base de données croissante contient désormais les structures 3D de près de trois millions de cavités à la surface de près de 110 000 molécules.

Cancer Research UK et l’ICR garantissent ensemble que cette ressource est gratuite pour les chercheurs du monde entier, leur donnant un accès rapide aux informations clés.

Le Dr Bissan Al-Lazikani, chef d’équipe en biologie computationnelle à l’Institute of Cancer Research de Londres, qui a dirigé l’équipe financée par Cancer Research UK qui a développé canSAR, a déclaré : « Notre base de données ne cesse de s’enrichir d’informations et est la plus grande du genre. – avec plus de 140 000 utilisateurs de plus de 175 pays. Et nous développons régulièrement de nouvelles technologies d’intelligence artificielle qui aident les scientifiques à faire des prédictions et à concevoir des expériences. Notre objectif est que les scientifiques du cancer disposent des données dont ils ont besoin pour mener des recherches vitales sur les médicaments les plus passionnants du futur.

« Les scientifiques doivent trouver toutes les informations disponibles sur un gène ou une protéine défectueux pour comprendre si un nouveau médicament pourrait fonctionner. Ces données sont vastes et dispersées, mais la base de données canSAR les rassemble et ajoute de la valeur en identifiant les liens cachés et en présentant facilement les informations clés.

Le professeur Paul Workman, directeur général de l’Institute of Cancer Research de Londres et membre de Cancer Research UK Life Fellow, a déclaré : « La base de données canSAR est un élément important de la volonté globale d’utiliser les approches Big Data pour comprendre et traiter le cancer plus efficacement. canSAR est une ressource extrêmement puissante qui est utilisée par les chercheurs à l’échelle mondiale pour accéder rapidement et facilement à une immense richesse de connaissances intégrées en biologie, en chimie et en médecine du cancer. Cette dernière recherche a considérablement amélioré la puissance de canSAR pour permettre aux scientifiques de sélectionner les meilleures cibles possibles pour la découverte future de médicaments anticancéreux et également pour les aider à développer des médicaments vraiment innovants beaucoup plus rapidement et efficacement que jamais auparavant au profit des patients atteints de cancer dans le monde entier.

Le Dr Kat Arney, responsable de l’information scientifique chez Cancer Research UK, a déclaré : « Cette base de données met à la disposition des scientifiques du monde entier des masses d’informations scientifiques détaillées sur le cancer et accélérera les avancées cruciales dans la découverte de médicaments, sauvant ainsi davantage de vies. Trouver de nouveaux traitements contre le cancer peut être un processus long et coûteux, donc tout ce qui réduit les délais et les coûts aidera à apporter la prochaine génération de thérapies aux patients encore plus tôt.

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Les références

*Tym et al. canSAR : une base de connaissances mise à jour sur la recherche sur le cancer et la découverte de médicaments. Recherche sur les acides nucléiques.

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** La base de données canSAR est disponible en ligne : https://cansar.icr.ac.uk/