La carte des gènes du cancer révèle de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles

Des chercheurs aux États-Unis ont créé une carte complète des gènes sur lesquels les cellules tumorales s’appuient pour survivre.

Le projet du Broad Institute du MIT et du Harvard and Dana-Farber Cancer Institute visait à produire un catalogue des faiblesses génétiques du cancer – à trouver les gènes dont les cellules tumorales dépendent pour rester en vie et se développer.

« Cette étude importante met en lumière la façon dont les cellules cancéreuses humaines dépendent de gènes particuliers » – Professeur Paul Workman, The Institute of Cancer Research, Londres

« Cette étude importante met en lumière la façon dont les cellules cancéreuses humaines dépendent de gènes particuliers », a déclaré le professeur Paul Workman, expert en découverte de médicaments financé par Cancer Research UK à l’Institute of Cancer Research de Londres. « Les gènes identifiés pourraient être des cibles pour les efforts de découverte de médicaments pour trouver de nouveaux traitements ciblés. »

Les chercheurs ont étudié plus de 500 lignées cellulaires cancéreuses humaines différentes, représentant plus de 20 types de cancer. Ce sont des cellules que les scientifiques peuvent continuer à cultiver en laboratoire, et ils ont examiné les effets de la désactivation de milliers de gènes.

Cela a permis de découvrir 769 gènes dont les cellules cancéreuses dépendaient pour leur survie.

Alors qu’un grand nombre de ces faiblesses étaient spécifiques à des types de cancer particuliers, environ 1 sur 10 a été trouvée dans plusieurs types de cancer. Cela suggère que le ciblage de ces gènes centraux pourrait être pertinent pour une gamme de cancers. Les résultats ont été publiés dans la revue Cellule.

Bien que l’équipe ait utilisé un grand nombre de lignées cellulaires, elles et d’autres ont souligné la nécessité d’études de suivi plus importantes pour compléter le tableau.

« Comme les auteurs l’ont dit, nous avons besoin d’efforts internationaux encore plus importants pour dresser une carte complète des dépendances au cancer », a déclaré Workman. Il a ajouté que les études à venir utilisant la technologie d’édition de gènes CRISPR pourraient aider à combler les lacunes dans les connaissances.

« La méthode innovante utilisée par les chercheurs réduit également la probabilité de produire des résultats incorrects – un problème qui a tourmenté des études similaires dans le passé. »

Les scientifiques ont également découvert que la meilleure façon de prédire de telles dépendances était d’examiner les modèles d’activité des gènes, plutôt que de se concentrer sur le fait qu’un gène individuel était défectueux – une découverte que Workman a qualifiée de « surprenante ».

Ces modèles, a-t-il dit, pourraient être utilisés pour identifier les patients qui pourraient bénéficier de traitements ciblés basés sur la génétique de leur tumeur.

Une étude similaire menée par un groupe de chercheurs de Novartis a également répertorié un grand nombre de vulnérabilités génétiques liées au cancer. Publié dans le même numéro de Cellule, les scientifiques ont documenté les effets de la désactivation de 7 837 gènes dans près de 400 lignées cellulaires.

Cela a permis de découvrir un mélange de gènes connus et nouvellement identifiés dont les cellules cancéreuses avaient besoin pour survivre. Les chercheurs ont également détaillé les connexions entre certains gènes et réseaux moléculaires.

Workman a déclaré que les deux études rapprochent les chercheurs de la construction d’une carte plus complète des gènes du cancer et de leurs fonctions.

« Les résultats fournissent une riche ressource de données que les chercheurs peuvent désormais explorer pour mieux comprendre la biologie du cancer et identifier de nouvelles cibles médicamenteuses », a-t-il ajouté.

Mais il a également souligné la nécessité d’aller au-delà des gènes nécessaires à la croissance et à la survie des cellules – par exemple, ceux impliqués dans l’environnement local de la tumeur et la réponse du système immunitaire. Cela inclurait également l’étude de systèmes plus complexes tels que les animaux ou les cellules cultivées sous forme de structures 3D appelées organoïdes.

Cet article a été mis à jour le 08/01/2017 pour inclure des informations sur le deuxième article de Cell.